2015年11月27日，環(huán)保部又公開批評15個項目的建設單位和編制環(huán)境影響報告書的環(huán)評單位弄虛作假。15個項目環(huán)評報告書公眾參與中的“公眾”，要么無法取得聯(lián)系，要么回應說未填過調(diào)查表。環(huán)保部斥責，這些項目環(huán)評公眾參與實際上是在走形式。
治標的同時，治本的制度建設也緊緊跟上。
2015年11月1日，環(huán)保部修訂后的《建設項目環(huán)境影響評價資質(zhì)管理辦法》正式實施，“從制度設計上徹底解決‘紅頂中介’問題”。
比如，不再將環(huán)評機構(gòu)評價范圍等級與環(huán)保部門審批級別掛鉤，明確規(guī)定負責審批或核準環(huán)評文件的主管部門及其所屬單位出資設立的企業(yè)、從事技術(shù)評估的企業(yè)，均不得申請環(huán)評資質(zhì)。
新管理辦法還建立了從國家到地方的四級誠信檔案數(shù)據(jù)庫，對環(huán)評機構(gòu)和從業(yè)人員違法違規(guī)行為及時進行記錄，并向社會公布。
標本兼治措施下，紅頂環(huán)評機構(gòu)脫鉤迅速推進、如期完成：2015年年底，環(huán)保部直屬的8家環(huán)評機構(gòu)率先完成了脫鉤，到去年底，所有地方環(huán)保部門350家環(huán)評機構(gòu)分兩批已經(jīng)全部完成了脫鉤任務。其中176家取消或者注銷了資質(zhì)，174家由原環(huán)評機構(gòu)職工自然人出資設立環(huán)評公司或者整體劃至國有資產(chǎn)管理部門。
“這意味著從今年開始，不論是人還是資產(chǎn)，沒有一家環(huán)評機構(gòu)跟環(huán)保部有任何關(guān)系，我們把這件事情切割得干干凈凈。”陳吉寧說。
基礎(chǔ)性制度變革：把環(huán)評要求都落實在排污許可證上
排污許可證制度，是陳吉寧上任后力推的又一重大舉措，也被環(huán)保系統(tǒng)內(nèi)人士評價為中國環(huán)境治理的基礎(chǔ)性制度的重大變革。
2016年11月21日，國務院發(fā)布《控制污染物排放許可制實施方案》，進一步落實中央關(guān)于改革環(huán)境治理基礎(chǔ)制度的部署，對污染物的排放者和管理者提出了新的要求。
而事實上，在這之前，陳吉寧已在多個場合透露了這一改革的信號。
2015年的國合會年會上，陳吉寧表達了許可制改革的最終目標：以排污許可制度為核心，整合各項環(huán)境管理制度，建立統(tǒng)一的環(huán)境管理平臺，實現(xiàn)排污企業(yè)在建設、生產(chǎn)、關(guān)閉等生命周期不同階段的全過程管理;實行一企一證;實行“一證式管理”;明晰各方責任，強化監(jiān)管，落實企業(yè)的誠信責任和守法主體責任，推動企業(yè)從被動治理轉(zhuǎn)向主動防范。
這之后，排污許可制改革成為了環(huán)保部低調(diào)推行的重要任務之一。2016年1月11日，環(huán)保部成立了排污許可證實施領(lǐng)導小組，并設置了綜合組、大氣組和水組3個工作組，開始部署地方試點工作，目前，海南省已經(jīng)拿到了環(huán)保部批復的排污許可證試點工作方案，開始深耕這塊改革的試驗田。
在2016年全國環(huán)境保護工作會議上，陳吉寧又發(fā)出信號：“所有固定污染源的企業(yè)排污許可制工作，先選擇污染物排放量較大、管理基礎(chǔ)較好的行業(yè)和地區(qū)開展試點，到2020年實現(xiàn)許可證發(fā)放覆蓋所有固定污染源。”
陳吉寧強調(diào)，固定污染源的企業(yè)排污許可制，要整合固定源環(huán)境管理的相關(guān)制度，實現(xiàn)一企一證、分類管理，強化證后監(jiān)管與處罰，使這項制度成為固定點源環(huán)境管理的核心制度。
整合環(huán)境影響評價、“三同時”驗收、主要污染物總量控制、排污申報、排污權(quán)交易等制度，將許可制度與前置審批、過程監(jiān)管、違規(guī)處罰等相銜接，實現(xiàn)制度關(guān)聯(lián)銜接、目標措施一體。
同時，陳吉寧還強調(diào)要落實企業(yè)主體責任，實行企業(yè)自主申請、舉證、監(jiān)測、公開的管理制度。建設國家污染源數(shù)據(jù)庫，構(gòu)建國家統(tǒng)管、四級聯(lián)網(wǎng)、面向公眾、社會公開的信息平臺。
在2017年3月9日的發(fā)布會上，陳吉寧又表示，環(huán)評改革要與排污許可證制度銜接，把環(huán)評要求的每一項環(huán)保措施落實在排污許可證上，作為下一步企業(yè)投產(chǎn)運行的守法依據(jù)，也作為環(huán)保人員執(zhí)法的依據(jù)。
“我們希望通過這樣的工作，一方面簡政放權(quán)，另一方面通過加強事中事后監(jiān)管，切實發(fā)揮環(huán)評的預防作用。”